「受注伝票出荷確定処理」に代用できる連携方法はないでしょうか?

「受注伝票出荷確定処理」についてご質問でございます。

上記APIは更新する伝票毎にリクエスト数がカウントされる仕様との事ですが、
当方の倉庫では毎月の出荷が1万近くなることもあり、コストの面でAPIの利用に踏み切れずおります。

やりたいことは「印刷済み」の伝票を一括で「出荷済み」に更新したいのですが、
手動で出荷実績csvを作成してアップロードする作業を無くしたいということです。
出荷実績CSVを生成しアップロードAPIでネクストエンジンへファイル取込むなど、
1日に1回のリクエスト数で済むような連携方法はございませんでしょうか?

出荷確定処理APIは仕様上、1件ずつ処理していただく必要がございます。
ご理解のほどよろしくお願いします。